直通 Wolfram 研发:Wolfram 化学概览

发布:小火龙果 2023-06-01 09:19 阅读:1008
Y)I8eU{Wl(  
*r,b=8|  
(lH,JX`$a  
+cB&Mi5  
内容大纲
eE]hy'{d<  
  • Wolfram语言中的化学简史
    YJF#)TkF  
    ChemicalData -> Entity -> Molecule
    RW7(r/C  
化学表达式
>_ \<E!j  
  • ChemicalFormula
  • ChemicalReaction
  • MoleculeName
  • FindIsomers
    "$^0%-  
分子可视化
4? (W%?  
  • 原子和键合标签
  • 新的绘图功能
    9'~- U  
模式匹配
<vc`^Q&4B  
  • MoleculeMatchQ
  • MoleculeSubstructureCount, MoleculeContainsQ, MoleculeFreeQ
    !u;>Wyd W  
化学转换
FeaturespacePlot
Wolfram化学资源
ljJ>;g+  
$#NQ <3  
Wolfram 语言中的化学简史
mZvG|P$}  
  • ChemicalData
    oQ2KW..q  
T1Ta?b  
化学表达式
KLQ!b,=q  
"Chemical" 实体
j|(Z#3J  
  • 从第10版开始,实体为Wolfram知识库提供了一个统一的接口
  • 扩展了查询多个实体或多个属性的语法
    $1Nd_pD=  
B |{I:[  
Molecule:一个可计算的化学对象
  • 第12版引入了Molecule,一个可计算的对象,可以代表任何单一的分子:
    cPF<D$B  
5\4g>5PD  
一个分子是由原子和键组成的: 0 t.p1  
{padD p  
分子属性按需计算: ~6[*q~B  
3{Q,h pZN  
可以通过 MoleculeModify 轻松改变结构:
XSRdqU>Aun  
L2z2}U=<  
: mGAt[Cc  
Oe]&(  
#Z!b G?="  
ChemicalFormula U9d:@9Y  
  • 一个 "化学 "实体代表一个在知识库中具有记录的单一化学物类,其具有完整的属性,如熔点、比热容等;
  • 一个分子可以是任何化学结构,必须有指定的连通性;
  • 化学式(ChemicalFormula)只有一个原子类型及其系数的列表——它代表具有给定公式的任何(或所有)化学物类。
    Sfjje4R  
(M-ZQ -  
  • 化学式有明确的分子质量和电荷:
    NY B[Zyp  
2z0n<`  
  • 一个分子可以与一个给定的公式相匹配
    h 8 @  
pxINw>\Qv  
v:_B kHN'  
ChemicalReaction
773/#c  
获取反应物或产物: /X8 <C=}  
CQg X=!q  
获取产物的计数:
' P"g\;Ij  
显示反应式: 83ipf"]*  
x%> e)L<  
根据方程式串创建化学反应:
5i So8*9}  
这里的输入被解释为化学式:
l5t2\Fl  
根据 ReactionSMILES 字符串创建化学反应:
Kp iF0K  
在这里,反应的组成部分是分子对象: JC;^--0(z  
f^<6`Aeq  
分子可视化
使用 IUPAC 名称创建分子。 *JCQu0  
使用绘图主题来控制是否显示氢或如何描述芳烃键。
ug&[ IL~lc  
Vd9@Dy  
MoleculePlot3D 有助于快速生成交互式绘图,其绘图主题对应于常见情形。
u=+q$Q]  
通过参考原子索引来突出原子或键。 /\d$/~BFi  
}E^S]hdvz  
AtomLabels
  • AtomLabels 和 BondLabels 是 MoleculePlot 和 MoleculePlot3D 的新选项。 ^s/  
;GHvPQc_  
r4 dOK] 0  
t2{~bzq1X  
~[PKcEX  
T5lQIr@a  
范例: 分子图,按其氧化状态标记所有的碳原子和氮原子 )hKS0`$|  
`m~syKz4A  
y6HuN  
VL( <  
QP I+y8N=  
WgR4Ix^L#  
模式匹配
MoleculeMatchQ 2h^WYpCm  
  • 加入其他 Molecule 模式匹配函数: p#d+>7  
    4g _"ku  
  • FindMoleculeSubstructure
  • MoleculeContainsQ
  • MoleculeFreeQ
  • MoleculeSubstructureCount
    (zo^Nn9VJ  
检验两个分子是否相互匹配:
'C+;r?1!h  
检验分子是否与化学式相匹配: "i)Yvh[y  
/i|z.nNO  
检验分子是否与模式相匹配: $6f\uuTU2"  
f`<FT'A  
eARk QV  
一个双原子分子可以与键相匹配: wzcai 0y*  
f>Td)s1 M  
o,Z{ w"  
J QKdW  
默认情况下,立体异构体之间不匹配: W=}Okq)x9I  
/L=(^k=a.;  
范例:绘制糖的二维图,用原子的立体感来标记原子 (il0M=M  
<!^ [~`  
P.WYTst=  
v@ C,RP9  
范例:使用子结构模式过滤异构体列表 MLVB^<qkeH  
  • 找到在氧和氮之间有一个芳香键的咖啡因的异构体,并将它们排列在最大的共同子结构上 tl8O6`<Z  
  • 本范例使用了 FindIsomers、MoleculeContainsQ、MoleculeMaximumCommonSubstructure 和 MoleculeAlign [G|mY6F^  
Sq]pQ8  
D@Da0  
#~ v4caNx  
>O`l8tM  
  • 现在在三维空间中排列所有分子 \y Hen|%  
 ^y.UbI  
8}p8r|d!ls  
化学转换
计算 2300 毫克钠所含的毫摩尔数: K\! #4>yd  
my\&hCE  
计算 10 毫升水的分子数: [2Mbk~  
4n( E;!s  
计算 10 摩尔氦气的体积,单位为立方英尺: x!TZ0fq0  
]Tp U"JD  
PBqy F  
有多少摩尔的二磷酸三钙 Ca3(PO4)2 :>3=gex@^0  
Ws[D{dS/  
计算 Ca3(PO4)2 和 Ca(OH)2  的化学计量比率 U..<iNQE5  
8^ep/b&|  
将 5 克的 Ca(OH)2 转换为 Ca3(PO4)2: V-W'RunnW  
&V=7D#L  
1TJ0D_,  
FeatureSpacePlot
XJ\hd,R   
12.3 版本为分子对象引入了新的内置特征提取器。 W.}].7}h  
H?rg5TI0  
C0 ) Z6  
C*~aSl7  
%IZ)3x3l  
! >.vh]8g  
Wolfram 化学资源
a' FN 3  
一个为 Wolfram 世界中化学内容资源而策划的门户。 w<wV]F*  
  • 化学工具 2!&pEqs  
Wolfram|Alpha——使用自然语言的化学计算器Wolfram|Alpha 笔记本编辑器 ——数字笔记本中的多步骤化学计算Wolfram 演示项目 ——交互式化学演示工具Wolfram 语言——化学函数的分子系列 dbGgD=}o  
Wolfram 函数资源库——专业化学函数 >>'C :7+Y  
Wolfram 数据资源库——可计算化学数据组 -E>)j\{PX7  
  • 计算器 t%0?N<9YkU  
减少认知负荷,促进实验设计中更深层次的化学思维。 rGwIcx(%  
0irr7Y  
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【13.2.1中英文 Wolfram 软件】欢迎评论区留言
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